Líneas de Investigación

En el laboratorio estamos interesados en entender el desarrollo de las plantas en relación con su ambiente y el cómo puede afectar los procesos evolutivos. Para esto estudiamos las redes transcripcionales en procesos importantes del desarrollo, a partir de los meristemos apicales de las plantas después de la germinación. Particularmente nos interesan aquellas relacionadas con la transición a la floración y el desarrollo de la raíz en Arabidopsis thaliana, como planta modelo. También analizamos el papel de las fitohormonas como parte esencial de la intermediación entre las señales ambientales y las respuestas moleculares y celulares que afectan el desarrollo de las plantas.

Palabras Clave: meristemos apicales, transición a la floración, desarrollo de la raíz, fisiología vegetal, citoesqueleto, factores transcripciones MADS-box, Arabidopsis thaliana.

Formación Académica

Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias, U.N.A.M. (1992)

Maestría en Biotecnología. Instituto de Biotecnología, U.N.A.M. (pase directo al doctorado)

Doctorado en: Biotecnología. Instituto de Biotecnología, U.N.A.M. (2000).

Posdoctorado en el Centro Nacional de Biotecnología (CSIC), Madrid, España (2000-2003). Proyectos elaborados: a) Clonación y caracterización de mutantes de Arabidopsis thaliana afectados en arquitectura radicular; b) identificación de las bases moleculares implicadas en la tolerancia al arsénico en Arabidopsis.

Experiencia profesonal

Experiencia Laboral

Investigador Asociado C de Tempo Completo. Instituto de Biotecnología,(2003 - 2005).

Investigador Asociado C de T. C. Instituto de Ecología, UNAM (2005 - 2008).

Investigador Titular A de T. C. Instituto de Ecología, UNAM (2008 - presente).

Experiencia Docente

16 cursos del Taller: Genética molecular, Desarrollo y Evolución de Plantas: Enfoques Experimentales y Teóricos. Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias, UNAM (2012-presente).

25 Cursos impartidos a los posgrados de Ciencias Biomédicas, C. Biológicas y C. Bioquímicas en la UNAM.

Premios y Distinciones

SNI II.

PRIDE C.

Mención honorífica en el examen de grado de la Licenciatura en Biología.

Nombramiento como miembro numerario de la Sociedad Mexicana de Bioquímica desde julio de 2004.

Seleccionada para formar parte del Directorio de Expertos en Bioseguridad de la CONABIO (2004).

 

Líneas de investigación:

1) Regulación genética de la transición a la floración en respuesta a señales fisiológicas y ambientales. Durante el ciclo de vida de las plantas anuales, hay un momento esencial en su desarrollo y es cuando transitan del estado vegetativo al reproductivo. La producción de semillas y su capacidad de sobrevivencia, dependen en buena medida de que la floración se dé en la época idónea para cada especie de angiospermas, por lo tanto la regulación de este proceso en respuesta tanto a señales endógenas del desarrollo, como a las múltiples señales ambientes, es fundamental para que se pueda llevar a cabo. En nuestro laboratorio analizamos el papel de algunos factores de transcripción tipo MADS-box en esta gran red de regulación genética.

2) Estudio de la identidad y mantenimiento de los meristemos de Arabidopsis thaliana. En plantas, la mayor parte de su desarrollo se da post-germinación a partir de los meristemos apicales y es ahí, donde se regulan el desarrollo de los órganos en respuesta al ambiente. Utilizando mutantes y líneas de sobreexpresión analizamos el efecto de algunos genes en la proliferación celular, así como en la identidad de los meristemos de la raíz y de la parte aérea de la planta.

3) Efecto del impedimento mecánico en el desarrollo de la raíz de A. thaliana. Las raíces de las plantas, tienen que enfrentar todo tipo retos durante su desarrollo, posiblemente los más conocidos son la búsqueda de agua y de nutrientes, así como su respuesta ante algunos patógenos. Sin embargo, poco se sabe sobre los eventos moleculares implicados en la evasión a obstáculos que afecta directamente su capacidad para penetrar los suelos. En nuestro laboratorio, hemos venido estudiando el efecto del citoesqueleto de actina y de otras proteínas durante este proceso.    

1. García-Gómez M, Ornelas-Ayala D, Garay-Arroyo A, García-Ponce B, Sánchez MP, Elena Álvarez-Buylla E* (2020). A system-level mechanistic explanation for asymmetric stem cell fates: Arabidopsis thaliana root niche as a study system. Scientific Reports 10(1): 3525. doi.org/10.1038/s41598-020-60251-8. ISSN 2045-2322 [FI 4.5].

2. Ornelas-Ayala D, Vega-León R, Petrone-Mendoza E, Garay-Arroyo A, García-Ponce B, Álvarez-Buylla ER, Sanchez MP*. (2020). ULTRAPETALA1 maintains Arabidopsis root stem cell niche independently of ARABIDOPSIS TRITHORAX1. New Phytol. 225(3):1261-1272. doi: 10.1111/nph.16213. ISSN 1469-8137 [FI 7.3].

3. Cajero-Sanchez W1, Aceves-Garcia P1, Fernández-Marcos M, Gutiérrez C, Rosas U, García-Ponce B, Álvarez-Buylla ER, Sánchez MP* and Garay-Arroyo A* (2019). Natural Root Cellular Variation in Responses to Osmotic Stress in Arabidopsis thaliana Accessions. Genes 10 (12): 983. doi:10.3390/genes10120983. ISSN 2073-4425 [FI 3.3].

4. Castelán-Muñoz N1, Herrera J1, Cajero-Sánchez W, Arrizubieta M, Trejo C, Garcia-Ponce B, Sánchez MP, Álvarez-Buylla ER, Garay-Arroyo A* (2019). MADS-box genes are key components of genetic regulatory networks involved in abiotic stress and plastic developmental responses in plants. Front. Plant Sci. 10: 853. doi: 10.3389/fpls.2019.00853. ISSN 1664-462X [FI 4.1].

5. Alvarez-Buylla ER*, García-Ponce B, Sánchez MP, Espinosa-Soto C, García-Gómez ML, Piñeyro-Nelson A and Garay-Arroyo A* (2019). MADS-box genes underground becoming mainstream: plant root developmental mechanisms. New Phytol. 223(3): 1143-1158. doi: 10.1111/nph.15793. ISSN 0028-646X [FI 7.3].

6. Cajero Sánchez W, García-Ponce B, Sánchez MP, Álvarez-Buylla ER and Garay-Arroyo A* (2017). Identifying the transition to the maturation zone in three ecotypes of Arabidopsis thaliana roots. Communicative & Integrative Biology 11(1): e1395993, doi: 10.1080/19420889.2017.1395993 ISSN: Print 1942-0889. [FI: 1.56].

7. Elena R. Álvarez-Buylla, Adriana Garay-Arroyo, Berenice García-Ponce de León, María de la Paz Sánchez, Emmanuel González-Ortega, José Dávila-Velderrain, Juan Carlos Martínez-García y Alma Piñeyro-Nelson* (2017). La Ecología Evolutiva del Desarrollo en México. Revista Mexicana de Biodiversidad 88(1): 14-26 doi: 10.1016/j.rmb.2017.10.009 ISSN: 1870-3453 (impreso), 2007-8706 (electrónico). [FI: 0.60].

8. Alarcón T, Castillo J, García-Ponce B, Herrero MA and Padilla P (2016). Growth rate and shape as possible control mechanisms for the selection of mode development in optimal biological branching processes. The European Physical Journal: Special Topics 225(13-14): 2581-2589 doi: 10.1140/epjst/e2016-60032-0 ISSN: 1951-6355 (print version), 1951-6401 (electronic version). [FI 1.417].

9. García-Cruz KV1, García-Ponce B1, Garay-Arroyo A, Sánchez MP, Ugartechea-Chirino Y, Desvoyes B, Pacheco-Escobedo MA, Tapia-López R, Ransom-Rodríguez I, Gutierrez C and Alvarez-Buylla ER* (2016). The MADS-box XAANTAL1 increases proliferation at the Arabidopsis root stem-cell niche and participates in transition to differentiation by regulating cell-cycle components. Annals of Bot. 118(4): 787-796 doi: 10.1093/aob/mcw126. ISSN: 0305-7364 [FI 3.6].

 10. Aceves-García P, Álvarez-Buylla ER, Garay-Arroyo A,  García-Ponce B, Muñoz R, and Sánchez MP*. (2016). Root architecture diversity and meristem dynamics in different populations of Arabidopsis thaliana. Front. Plant Sci. 7(858): 1-14 doi: 10.3389/fpls.2016.00858. ISSN: 1664-462X [FI 4.1].

11. Pérez-Ruiz RV1, García-Ponce B1*, Marsch-Martínez N, Ugartechea-Chirino Y, Villajuana-Bonequi M, de Folter S, Azpeitia E, Dávila-Velderrain J, Cruz-Sánchez D, Garay-Arroyo A, Sánchez MP, Estévez-Palmas JM, and Alvarez-Buylla ER* (2015). XAANTAL2 (AGL14) is an important component of the complex gene regulatory network that underlies Arabidopsis shoot apical meristem transitions. Molec. Plant 8: 796-813. doi: 10.1016/j.molp.2015.01.017. ISSN: 1674-2052 [FI: 9.3].

12. Rodríguez-Mega E, Piñeyro-Nelson A, Gutierrez C, García-Ponce B, Sánchez MP, Zluhan-Martínez E, Álvarez-Buylla ER and Garay-Arroyo A* (2015). Role of transcriptional regulation in the evolution of plant phenotype: a dynamic systems approach. Developmental Dynamics 244: 1074-1095 doi: 10.1002/dvdy.24268. ISSN: 1058-8388 [FI: 2.37].

13. Sanchez MP*, Aceves-García P, Petrone E, Steckenborn S, Vega-León R, Alvarez-Buylla ER, Garay-Arroyo A and García-Ponce B. (2015). The impact of Polycomb group (PcG) and Trithorax group (TrxG) epigenetic factors in plant plasticity. New Phytol. 208: 684-694 doi: 10.1111/nph.13486. ISSN: 0028-646X; electrónico 1469-8137 [FI: 7.43].

14. Garay-Arroyo A1, Ortiz-Moreno E1, de la Paz Sánchez M, Murphy AS, García-Ponce B, Marsch-Martínez N, de Folter S, Corvera-Poiré A, Jaimes-Miranda F, Pacheco-Escobedo MA, Dubrovsky JG, Pelaz S and Alvarez-Buylla ER* (2013). The MADS transcription factor XAL2/AGL14 modulates auxin transport during Arabidopsis root development by regulating PIN expression. EMBO J 32(21): 2884-2895 doi: 10.1038/emboj.2013.216. ISSN: 0261-4189 [FI: 10.43].

15. Lanza M1, García-Ponce B1, Castrillo G1, Catarecha P1, Rodriguez-Serrano M, Sauer M, Páez-García A, Sánchez-Bermejo E, Mohan TC, Leo del Puerto Y, Sandalio LM, Paz-Ares A and Leyva A* (2012). Role of actin cytoskeleton in brassinosteroid signaling and in its integration with the auxin response in plants. Developmental Cell 22(6): 1275-1285 doi: 10.1016/j.devcel.2012.04.008. ISSN: 1534-5807 [FI: 9.7].

16. Garay-Arroyo A1*, Sánchez MP1, García-Ponce B, Azpeitia E, and Álvarez-Buylla ER* (2012). Hormone symphony during root growth and development. Developmental Dynamics 241(12):1867-1885. doi: 10.1002/dvdy.23878. ISSN: 1058-8388 [FI: 2.37].

17. Garay-Arroyo A1, Piñeyro-Nelson A1, García-Ponce B, Sánchez MP and Álvarez-Buylla ER* (2012). When ABC becomes ACB. J. Exp. Bot. 63(7): 2377-2395 doi: 10.1093/jxb/ers024. ISSN: 0022-0957. [FI: 5.35].

18. Alvarez-Buylla ER1*, Ambrose BA1, Flores-Sandoval E1, Englund M, Garay-Arroyo A, García-Ponce B, de la Torre-Bárcena E, Espinosa Matías S, Martínez E, Piñeyro-Nelson A, Engström P and Meyerowitz EM (2010). B-Function Expression in the Flower Center Underlies the Homeotic Phenotype of Lacandonia schismatica (Triuridaceae). Plant Cell 22(11): 3543-3559 doi: 10.1105/tpc.109.069153. ISSN: 1040-4651. [FI: 8.2].

19. Tapia-López R1, García-Ponce B1, Dubrovsky JG, Garay-Arroyo A, Pérez-Ruíz RV, Kim SH, Acevedo F, Pelaz S and Alvarez-Buylla ER* (2008). An AGAMOUS-related MADS-box gene, XAL1 (AGL12), regulates root meristem cell proliferation and flowering transition in Arabidopsis thaliana. Plant Physiol. 146(3): 1182-1192 doi: 10.1104/pp.107.108647. ISSN: 0032-0889 [FI: 5.9].

20. Han P, García-Ponce B, Fonseca-Salazar G, Alvarez-Buylla ER and Yu H* (2008). AGAMOUS-LIKE 17, a novel flowering promoter, acts in a FT independent photoperiod pathway. Plant J. 55(2): 253-265 doi: 10.1111/j.1365-313X.2008.03499.x. ISSN: 0960-7412 [FI: 5.7].

21. Catarecha P1, Segura MD1, Franco-Zorrilla JM, García-Ponce B, Lanza M, Solano R, Paz-Ares J y Leyva A* (2007). A mutant of the Arabidopsis phosphate transporter PHT1-1 displays enhanced arsenic accumulation. Plant Cell 19(3): 1123-1133 doi: 10.1105/tpc.106.041871. ISSN: 1040-4651 [FI: 8.2].

22. Alvarez-Buylla ER*, García-Ponce B2 and Garay-Arroyo A2 (2006). Unique and redundant functional domains of APETALA1 and CAULIFLOWER, two recently duplicated Arabidopsis thaliana floral MADS-box genes. J. Exp. Bot. 57(12): 3099-3107 doi: 10.1093/jxb/erl081. ISSN: 0022-0957 [FI: 5.35].

23. Chaos A1, Aldana M1, Espinosa-Soto C, García-Ponce de León B, Garay Arroyo A and Alvarez-Buylla ER* (2006). From genes to flower patterns and evolution: Dynamic models of gene regulatory networks. J. of Plant Growth Regulation 25: 278-289 doi: 10.1007/s00344-006-0068-8. ISSN: 0721-7595 [FI: 1.990].

24. Figueroa-Balderas RE, García-Ponce B and Rocha-Sosa M* (2006). Hormonal and Stress Induction of the Gene Encoding Phaseolus vulgaris Acetyl-CoA Carboxylase. Plant Physiol. 142(2): 609-619 doi: 10.1104/pp.106.085597. ISSN: 0032-0889 [FI: 5.9].

25. García-Ponce de León B, Franco Zorrilla JM, Rubio V, Dahiya P, Paz-Ares J and Leyva A* (2004). Interallelic complementation at the Arabidopsis CRE1 locus uncovers independ pathways for the proliferation of vascular initials and canonical cytokinin signalling. Plant J. 38(1): 70-79 doi: 10.1111/j.1365-313X.2004.02023.x. ISSN: 0960-7412 [FI: 5.7].

26. Mohammad A, Miranda-Ríos J, Estrada Navarrete G, Quinto C, Olivares JE, García-Ponce B and Sánchez F* (2004). Nodulin 22 from Phaseolus vulgaris protects E. coli cells from oxidative stress. Planta 219(6): 993-1002 doi: 10.1007/s00425-004-1303-9. ISSN: 0032-0935 [F I: 3.24].

27. García-Ponce B and Rocha-Sosa M* (2000). The octadecanoid pathway is required for pathogen-induced multi-functional acetyl-CoA carboxylase accumulation in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Plant Science 157(2): 181-190 doi: 10.1016/S0168-9452(00)00285-5. ISSN: 0168-9452. [FI: 3.7].

28. González-Halphen D*, Vázquez-Acevedo M and García-Ponce B (1991). On the interaction of mitochondrial complex III with the Rieske iron-sulfur protein (subunit V). J. Biol. Chem. 266(6): 3870-3876. ISSN: 0021-9258. [FI: 4.651].

Publicaciones en revistas no ISI

1. Garay-Arroyo A*, Sánchez MP, García-Ponce B, Álvarez-Buylla ER, Gutiérrez C. (2014). La homeostasis de las auxinas y su importancia en el desarrollo de Arabidopsis thaliana. Revista de Educación Bioquímica 33(1): 13-22. Órgano de información de la Asociación Mexicana de Profesores de Bioquímica, A.C. (ISSN 1665-1995).

2. Alvarez-Buylla E1, Benítez-Keinrad M1, Corvera A1, Chaos-Cador A1, de Folter S1, Gamboa de Buen A1, Garay-Arroyo A1, García-Ponce B1, Jaimes-Miranda F1, Pérez-Ruíz R1, Piñeyro-Nelson A1 and Sánchez-Corrales Y1 (2010). “Flower Development” in The Arabidopsis Book 8: e0127 1-57p doi: 10.1199/tab.0127 ISSN: 1543-8120.

Capítulos de libros

1. Alvarez-Buylla  E1, Corvera-Poiré A1, Garay-Arroyo A1, García-Ponce B1, Jaimes-Miranda F1 and Pérez-Ruiz R1 (2011). “A MADS View of Plant Development and Evolution”, en Topics in Animal and Plant Development: From Cell Differentiation to Morphogenesis: 181-220. Editor: Jesús Chimal-Monroy. (ISBN: 978-81-7895-506-3).

2. Piñeyro-Nelson A, Flores-Sandoval E, Garay-Arroyo A, García-Ponce B and Alvarez-Buylla ER* (2010). “Development and Evolution of the Unique Floral Organ Arrangement of Lacandonia schismatica” en International Journal of Plant Developmental Biology 4 (Special Issue 1): 86-97 (ISBN 978-4-903313-49-8).

Artículos de difusión

1. García Ponce de León Berenice*, Quiroz Pérez Stella, Yustis Rubio Juan Carlos, Martínez Hidalgo Tania, Garay-Arroyo Adriana, Sánchez Jimenez María de la Paz y Álvarez-Buylla Roces Elena (2020). La regulación genética de la floración. Mensaje Bioquímico 44 XX-XX.

2. Flores-Sánchez Julio, Petrone-Mendoza Emilio, Steckenborn Stefan, Garay-Arroyo Adriana, García Ponce de León Berenice, Álvarez-Buylla Elena y Sánchez María de la Paz* (2013). El control epigenético en el desarrollo de las plantas a través de PcG Y TrxG. Mensaje Bioquímico, Vol. XXXVII, 109-126, Depto. de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México (ISSN 0188-137x)

3. Berenice García Ponce de León1, Adriana Garay-Arroyo, Alma Piñeyro Nelson, María de la Paz Sánchez, Esteban Martínez y Elena R. Álvarez-Buylla* (2011). Lacandonia schismatica: ventana a la evolución del desarrollo. Revista Ciencia y Desarrollo 237(253): 48-55.

4. Elena Álvarez-B1., Ana Luisa Anaya1, Víctor L. Barradas1, Mariana Benítez1, Julio Campo1, Rocío Cruz1, Alicia Gamboa1, Adriana Garay1, Berenice García1, Ana Mendoza1, Rigoberto Pérez1, Alma Orozco1, María Esther Sánchez1, María Paz Sánchez1, Enrique Solís1 (2011). De los genes al cambio climático. Revista Ciencias 103: 54-64.

5. Adriana Garay-Arroyo*, Berenice García-Ponce, Rigoberto V. Pérez-Ruiz, Alma Piñeyro-Nelson y Maria de la Paz Sánchez (2011). La genética de la flor y la sexualidad de las plantas. Revista Oikos 4: 14-21.

 

Licenciatura

Gabriel Sinué Fonseca Salazar. Título de tesis “Caracterización del fenotipo radicular de algunos mutantes de los genes MADS-box del clado de ANR1 de Arabidopsis thaliana bajo condiciones de estrés por carencia de nitratos y fosfatos”. Facultad de Ciencias, UNAM, 113 p. Titulación 23/2/07.

Jonathan Israel Rodríguez López. Título de tesis “Caracterización de la nodulina 22 de frijol y sus homólogos de Arabidopsis thaliana en respuesta al estrés oxidativo”. Facultad de Biología, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, 70 p. Titulación 18/5/07.

Ursula Citlalli Abad Vivero. Título de tesis “Identificación de mutaciones supresoras y potenciadoras de un mutante de citoesqueleto con respuesta trópica alterada”. Facultad de Ciencias, UNAM, 69 p. Titulación 25/6/09.

Andrea Lizbeth Domínguez Román. Título de tesis “Estudio de algunos genes MADS-box y sus interacciones genéticas en la regulación del tiempo de floración en Arabidopsis thaliana”. Facultad de Biología, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, 74 p. Titulación 15/6/12.

Alba Itzel Martínez Salazar. Título de tesis “Efecto de la luz, la sacarosa y la fricción en el crecimiento de la raíz de plantas silvestres y mutantes de Arabidopsis thaliana”. Facultad de Ciencias, UNAM, 81 p. Titulación 1/6/16.

Rubén Agustín Camacho Ramírez. Título de tesis “Efecto del estrés osmótico y salino en el tiempo de floración y la descendencia de Arabidopsis thaliana (ecotipo Columbia): evaluación de la participación de algunos genes MADS-box en estos procesos”. Facultad de Ciencias, UNAM, 78 p. Titulación 6/12/16.

Roberto Domínguez Adán. Título de tesis “Papel de XAANTAL1 en la transición a la floración de Arabidopsis thaliana, en respuesta al fotoperiodo de día largo y temperatura elevada”. Facultad de Ciencias, UNAM, 68 p. Titulación 10/1/17. Mención honorífica en la Sexta Entrega del Premio Carlos Enrique Chávez Solís a la mejor tesis.

Jorge Uriel Dimas Torres. Título de tesis “Análisis celular de la raíz del mutante medium-size root (mer) de Arabidopsis thaliana”. Facultad de Estudios Superiores Iztacala, UNAM, 69 p. Titulación 22/2/18.

Juan Carlos Junior Yustis Rubio. Título de tesis Regulación del factor de transcripción MADS-box AGL19 y sus transcritos alternativos en Arabidopsis thaliana”. Facultad de Ciencias, UNAM, 90 p. Titulación 3/4/18.

Stella Alejandra Quiroz Pérez. Título de tesis “Efecto de la fosforilación en el desarrollo de la raíz y la configuración del citoesqueleto de actina en plantas silvestres y el mutante act2-5 de Arabidopsis thaliana”. Facultad de Ciencias, UNAM, 79 p. Titulación 5/4/18 con mención honorífica.

Tania Martínez Hidalgo. Título de tesis “Efecto del impedimento mecánico en el crecimiento de la raíz del mutante xal1-2 de Arabidopsis thaliana”. Facultad de Ciencias, UNAM, 60 p. Titulación 5/9/18.

Maestría

David Cruz Sánchez. Título de tesis “Participación del gen AGL19 en el establecimiento del meristemo floral y el tiempo de floración”. Maestría en Ciencias Biológicas (Biología Experimental), Inst. Ecología, UNAM, 60 p. Titulación 9/4/10.

Gabriel Sinué Fonseca Salazar. Título de tesis “Caracterización funcional de AGL17 en el desarrollo radicular de Arabidopsis thaliana”. Maestría en Ciencias Biológicas (Biología Experimental), Inst. Ecología, UNAM, 83p. Titulación 16/6/11.

Doctorado

Rigoberto Vicencio Pérez Ruiz. Título de tesis “Participación funcional del gen MADS-box AGL14 en redes transcripcionales que regulan el comportamiento del meristemo aéreo”. Doctorado en C. Biomédicas, Inst. Ecología, UNAM, 90 p. Titulación con mención honorífica 23/10/15.